為規范醫療和基礎醫療機構會計核算，保證會計信息的真實、完整、根據《中華人民共和國會計法》、事業單位會計準則及國家有關法律法規的規定，財政部、衛生部制訂并頒布《醫院會計制度》、《基層醫療衛生機構會計制度》。《醫院會計制度》適用于中華人共和國境內各級各類獨立核算的公立醫院，包括綜合醫院、中醫院、專科醫院、門診（所）、療養院以及企業事業單位、社會團體及其他社會組織舉辦的非營利性醫院。《基層醫療衛生機構會計制度》適用于中國境內由政府舉辦的獨立核算的城市社區衛生服務中心（站）、鄉鎮衛生院以及企業事業單位、社會團體及其他組織舉辦的非營利性醫療衛生機構。《醫院會計制度》于2011年7月1日起在公立醫院改革國家試點城市實施，自2012年1月1日起全國施行；《基層醫療衛生機構會計制度》于2011年7月1日起施行。根據會計制度要求，暢捷通開發財務管理系統醫療專版，滿足各類醫院和基層醫療機構財務核算和管理需要。